Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CRXO43186 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CRXO43186 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CRXO43186 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CRXO43186 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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