Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms