Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms