Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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