Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A087WWV3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms