Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SERP1Q9Y6X1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms