Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP3Q9Y6F1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms