Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms