Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KIF3AQ9Y496 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIF3AQ9Y496 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIF3AQ9Y496 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KIF3AQ9Y496 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms