Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms