Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PNMA8BQ9ULN7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PNMA8BQ9ULN7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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