Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED23Q9ULK4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MED23Q9ULK4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms