Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF3C4Q9UKN8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms