Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms