Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUX4Q9UBX2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX4Q9UBX2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms