Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNAL1Q9UBT7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms