Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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COMMD9Q9P000 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD9Q9P000 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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