Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FBXL12Q9NXK8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms