Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CWC25Q9NXE8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms