Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf109Q9NX04 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf109Q9NX04 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms