Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ASF1BQ9NVP2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASF1BQ9NVP2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms