Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJB4Q9NTQ9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms