Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C19orf12Q9NSK7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms