Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SDHAF3Q9NRP4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF3Q9NRP4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms