Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2J2Q9GZM3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms