Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LNPKQ9C0E8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms