Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTFDC1Q9BY42 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms