Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAF4Q9BUZ4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms