Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PI4K2AQ9BTU6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms