Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP23Q9BRU9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UTP23Q9BRU9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms