Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GAD1Q99259 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GAD1Q99259 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms