Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB3A2Q96PL1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms