Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COG8Q96MW5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms