Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNBD2Q96M20 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNBD2Q96M20 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms