Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC136Q96JN2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC136Q96JN2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms