Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RNF185Q96GF1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF185Q96GF1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms