Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMD3Q96D46 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms