Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMPDL3BQ92485 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms