Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SH3RF3Q8TEJ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms