Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HAVCR2Q8TDQ0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HAVCR2Q8TDQ0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms