Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDND2Q8NHS1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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