Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00301Q8NCQ3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00301Q8NCQ3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms