Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POMGNT2Q8NAT1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms