Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTROBQ8N137 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTROBQ8N137 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms