Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-3Q8IUG1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-3Q8IUG1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms