Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPFIBP1Q86W92 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIBP1Q86W92 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms