Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT27Q7Z3Y8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT27Q7Z3Y8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms