Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC129Q6ZRS4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC129Q6ZRS4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms