Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00575Q6W349 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms