Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML4Q6UXN2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms